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R 的 20 年

最近有一篇文章从三个纬度介绍了 R 这 20 年的发展。

使用 VSCode 愉快地进行远程 R 开发

2019 年底(其实也就是半个多月之前)听了 renkun 大神在上海 R 会议的一个分享,分享主题是「Rstudio vs VSCode」,然后他紧接着又写了两篇使用 VSCode 进行 R 开发的博客。仔细了解之后,感觉自己有救了。

眼见不为实:为什么29不等于29

浮点数计算和比较的坑

Bioconductor 3.10正式发布

10月30日,Bioconductor 3.10 正式发布,该版本的bioc共包括了 1822 个软件包,384 个实验数据包,952 个注释包和 27 个工作流程,基于 R 3.6.1。

其中,新的软件包有93个,新的数据包15个,新的注释包2个,大量的旧包都进行了一波更新。

接下来推荐几个值得关注的最新软件包,以及一些经典包的重要更新。

macOS 10.15 安装R包

早先升级 macOS10.15 电脑 SMC 出了一些问题,试了一些方法都没有解决,无奈只能继续升级到public beta 版本。

船新版本 DESeq2 处理大量样本速度显著提升

太长不看版本

DESeq 最新版本(v1.25.9)针对大样本分析的速度和之前相比有了质的飞越,果子老师的 1215 个 TCGA 样本差异分析时间从 1200 分钟缩短到单线程 20 分钟,使用多线程的情况下最快 6 分钟搞定。

听说你也有 emojifont 的字体使用困惑

问题复现

Y 叔有一个神包,能够在 ggplot 图层里随心所欲的添加各种 emoji,然而很多人在使用的时候却不能「随心所欲」,经常一行函数输进去一张白板输出来。最近在我的星球里也有人提到这个问题,作为一个无趣的人我虽然之前没有实际使用过这个有趣的包,但是今天要被迫营业了。

大文本另类去重多种解法

今天分析数据的时候刚好碰到一个小问题,因为本身文件较大一开始想不出比较好的解决方法,睡个午觉醒来突然有了灵感,自认为目前解决的还算巧妙。

如何快速找到自己需要的 R 包

Bioconductor 的存在让只用 R 语言完成 (90% 的) 生物信息分析成为了一种可能,也在很大程度上推动了 R 在生物信息领域的应用和发展。目前 Bioconductor 配合 R 3.6 使用升级到了 3.9 版本。一共有 R 包 1741 个。学习生物信息和 R 语言,它是非常好的资源。

关于 Shiny 调试你应该知道的

Finding your bug is a process of confirming the many things that you believe are true — until you find one which is not true.

—Norm Matloff