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用漫威数据学习 ggplot2 facet

本文主要内容翻译整理自:Easy multi-panel plots in R using facet_wrap() and facet_grid() from ggplot2,部分代码有修改。

ggplot2 一个非常强大的功能就是进行 multi-panel plots 的呈现,也就是我们常说的分面(facet)。通过使用 facet_wrap() 或者 facet_grid() 这样的函数我们就可以很方面的将单一的一个图变为多个相关的图。本文将通过一个具体的数据示例帮助你理解 ggplot2 分面的不同方法以及参数。

每周文献-190330-DTU分析及转录组denovo拼接解析等

文献题目 Relative Abundance of Transcripts (RATs): Identifying differential isoform abundance from RNA-seq

每周文献-190322-DNA甲基化分析工具及silencers鉴定

文献题目:RnBeads 2.0: comprehensive analysis of DNA methylation data

学习新工具的思路

有两件事情,第一是前几天看到一个朋友分享了自己 学习生物信息工具的经验,借着这个机会刚好反思了一下自己过去几年是如何做的;第二是最近有人问了我一个问题:“使用 tophat 比对完的转录组数据 bam 文件想用 RNA-SeQC 来质控,但是这个软件好像没人维护了”(竟然还在用 tophat)。那这次就聊聊如何学习一个新的工具。

用 bedtools 和 bedops 对 bed 文件进行各种运算

bedtools 的傲人光环

如果让你说出日常在进行生物数据分析时,做的最多的事情是什么,我想不管你是什么方向,「不停地转换格式」应该能排进日常前三。如果再问用的最多的工具是什么,想必一定也是和「不停地转换格式」相关的工具。

RNAseq 必读综述和在线教程

最近读到一篇 博文,介绍了学习 RNAseq 数据分析非常推荐的两篇综述和七个在线教程并发表了相关评论。本文将进行简要整理并对相关评论内容进行大致翻译,供国内读者参考。

linux 去除文本中的空行

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  • tr
  • awk

给你的印象笔记模板使用心得

说明:本文首发于少数派。可在 少数派官网 阅读完整版本。

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服务器和 Windows 本地电脑无缝衔接

服务器和 Windows 本地电脑经常需要反复上传下载文件,对于初级用户来说通常会建议其下载类似于 winscp 之类的软件。但是这类高频操作有没有无需借助其它软件更方便的方法呢?