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靠谱熊的每周分享 第3期

刊首语

本周想分享一个「汉隆剃刀」经验法则:能解释为愚蠢的,就不要解释为恶意。

靠谱熊的每周分享 第1期

刊首语

在「素材学习分享小组」进行的第二个年头,为了让它能再向前走一小步,我们决定以电子杂志的形式发布「素材学习分享周刊」。

在家复工,学生党如何使用学术资源

本文首发于「少数派

Zotero入门学习路径

相关内容简述

学术文献管理和阅读工具其实主要包括管理和阅读两个需求。

所谓管理主要有三个层面的需求,一个是方便的把文献放到工具中去,然后可以提取出准确丰富的文献信息;另一个是可以把需要引用的文献方便的在写作工具中插入;第三个就是快速的找到自己想要的文献。阅读的话就是各种高亮和笔记的操作以及管理。同时还有不同平台同步的需求。

每周文献-190622-ATAC-seq和转录本从头组装新方法

HMMRATAC: a Hidden Markov ModeleR for ATAC-seq

DOI(url): https://doi.org/10.1093/nar/gkz533

杂志:Nucleic Acids Research

每周文献-190606-多篇结构变异和转录组分析方法文章

Alignment and mapping methodology influence transcript abundance estimation

DOI(url): https://doi.org/10.1101/657874

发表日期:June 03, 2019

随时随地跟踪最新热点文献

本文的图表及主要内容均来自 Meta-Research: Tracking the popularity and outcomes of all bioRxiv preprintsRxivist.org: Sorting biology preprints using social media and readership metrics 两篇文献,一篇发表在 elife 一篇发表在 plos biology,如果有兴趣不妨直接阅读原文。

每周文献-190419-植物单细胞BAM重比对以及假基因研究

A Single-Cell RNA Sequencing Profiles the Developmental Landscape of Arabidopsis Root

每周文献-190411-lncRNA功能exRNA分析以及DNA甲基化

Antisense lncRNA Transcription Mediates DNA Demethylation to Drive Stochastic Protocadherin α Promoter Choice

DOI(url): https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.03.008

发表日期:4 April 2019

关键点

反义 lncRNA 转录可以影响 DNA 甲基化,进而改变染色体结构促进增强子与启动子结合,调控基因表达。

每周文献-190330-DTU分析及转录组denovo拼接解析等

文献题目 Relative Abundance of Transcripts (RATs): Identifying differential isoform abundance from RNA-seq