Bioconductor 的存在让只用 R 语言完成 (90% 的） 生物信息分析成为了一种可能，也在很大程度上推动了 R 在生物信息领域的应用和发展。目前 Bioconductor 配合 R 3.6 使用升级到了 3.9 版本。一共有 R 包 1741 个。学习生物信息和 R 语言，它是非常好的资源。

本文提到的内容多余绝大多数人来说是没有必要的，因为你可以能一天也不会有几次搜索，但是对于一个如我这般常年「面向搜索编程」的人来说。一天搜索 30 次，每次节约 10 秒，就是 5 分钟，一年就是 30 个小时。

─=≡Σ(((つ •̀ω•́) つ 车速飚起来，坐稳扶好

Bioinformatics was like a box of chocolates. You never konw what you're gonna get ——阿飞正传

基本信息

• 原作名：Wait, What?: And Life's Other Essential Questions
• 作者：詹姆斯 ·E. 瑞安 (James E. Ryan)
• 页数：177
• 整理：思考问题的熊

A Single-Cell RNA Sequencing Profiles the Developmental Landscape of Arabidopsis Root

设计思维和更好的问题

这篇文章的主要内容来自 Roger Peng 最近的一篇博客 Tukey, Design Thinking, and Better Questions。读了之后有些启发便做简单记录。

Antisense lncRNA Transcription Mediates DNA Demethylation to Drive Stochastic Protocadherin α Promoter Choice

DOI(url): https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.03.008

发表日期：4 April 2019

关键点

反义 lncRNA 转录可以影响 DNA 甲基化，进而改变染色体结构促进增强子与启动子结合，调控基因表达。

Finding your bug is a process of confirming the many things that you believe are true — until you find one which is not true.

—Norm Matloff

本文主要内容翻译整理自：Easy multi-panel plots in R using facet_wrap() and facet_grid() from ggplot2，部分代码有修改。

ggplot2 一个非常强大的功能就是进行 multi-panel plots 的呈现，也就是我们常说的分面（facet）。通过使用 facet_wrap() 或者 facet_grid() 这样的函数我们就可以很方面的将单一的一个图变为多个相关的图。本文将通过一个具体的数据示例帮助你理解 ggplot2 分面的不同方法以及参数。