10 月 30 日，Bioconductor 3.10 正式发布，该版本的 bioc 共包括了 1822 个软件包，384 个实验数据包，952 个注释包和 27 个工作流程，基于 R 3.6.1。

其中，新的软件包有 93 个，新的数据包 15 个，新的注释包 2 个，大量的旧包都进行了一波更新。

接下来推荐几个值得关注的最新软件包，以及一些经典包的重要更新。

早先升级 macOS10.15 电脑 SMC 出了一些问题，试了一些方法都没有解决，无奈只能继续升级到 public beta 版本。

API

API 这个词在大多数人看来可能和 CNS 差不多，前者天天听说就是用不上，后者天天读就是发不了。

不过，通过今天的一个简短介绍，今后 API 这个东西你就用上了，因为在文章最后我将会展示一个最最基础且高频的 API 使用示例。

文章信息

Van den Berge, Koen, Katharina M. Hembach, Charlotte Soneson, Simone Tiberi, Lieven Clement, Michael I. Love, Rob Patro, and Mark D. Robinson. 2019. “RNA Sequencing Data: Hitchhiker’s Guide to Expression Analysis.” Annual Review of Biomedical Data Science 2 (1): 139–73. https://doi.org/10.1146/annurev-biodatasci-072018-021255.

太长不看版本

DESeq 最新版本（v1.25.9）针对大样本分析的速度和之前相比有了质的飞越，果子老师的 1215 个 TCGA 样本差异分析时间从 1200 分钟缩短到单线程 20 分钟，使用多线程的情况下最快 6 分钟搞定。

文献管理的需求和工具

学术文献管理其实主要包括了管理和阅读两个需求。

相关内容简述

如果你对代码编辑器完全没有任何概念，那么可以把所谓的代码编辑器理解为一个更加适合写代码的地方。

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好工具那么多，你知道如何学吗

比知道一个工具更重要的是想明白如何学习一个工具。**比如为了以 VS code 为例进行说明，我甚至在今天上午直接写了一个 VS code 插件。**是的，写了一个插件，不是用了一个插件。

拥有个人博客的几种途径

在越来越多的人已经没有耐心读完 140 字微博（micro-blog），短视频逐渐占据人们更多注意力的今天，博客（blog）——这一上个时代的产物——似乎正在被我们渐渐遗忘。

生物信息涉及到的工具方法过于庞杂，很多时候接触到一个新的内容总是不知该去哪里找相关的工具，还有很多时候找到的工具太多又不知道该用哪个。之前写过两篇文章 66 种测序数据分析方法和流程 和 如何快速找到自己需要的 R 包。分别从测序数据类型和 bioconductor 包两个角度介绍如何快速找到自己需要的工具。