很高兴和你相遇
这里正在记录我的所思所学
订阅免费邮件通讯接收最新内容
首页 归档 想法 工具 通讯 播客 简历 主页

macOS 10.15 安装R包

早先升级 macOS10.15 电脑 SMC 出了一些问题,试了一些方法都没有解决,无奈只能继续升级到 public beta 版本。

数据库网站 API 知多少

API

API 这个词在大多数人看来可能和 CNS 差不多,前者天天听说就是用不上,后者天天读就是发不了。

不过,通过今天的一个简短介绍,今后 API 这个东西你就用上了,因为在文章最后我将会展示一个最最基础且高频的 API 使用示例。

转录组表达分析知识图谱

文章信息

Van den Berge, Koen, Katharina M. Hembach, Charlotte Soneson, Simone Tiberi, Lieven Clement, Michael I. Love, Rob Patro, and Mark D. Robinson. 2019. “RNA Sequencing Data: Hitchhiker’s Guide to Expression Analysis.” Annual Review of Biomedical Data Science 2 (1): 139–73. https://doi.org/10.1146/annurev-biodatasci-072018-021255.

船新版本 DESeq2 处理大量样本速度显著提升

太长不看版本

DESeq 最新版本(v1.25.9)针对大样本分析的速度和之前相比有了质的飞越,果子老师的 1215 个 TCGA 样本差异分析时间从 1200 分钟缩短到单线程 20 分钟,使用多线程的情况下最快 6 分钟搞定。

Zotero入门学习路径

文献管理的需求和工具

学术文献管理其实主要包括了管理和阅读两个需求。

VScode入门学习路径

相关内容简述

如果你对代码编辑器完全没有任何概念,那么可以把所谓的代码编辑器理解为一个更加适合写代码的地方。

在 word 里你可以方便的进行文字的编排,在 PowerPoint 中你可以方便的进行幻灯片的制作,而一个好用的代码编辑器则可以帮助你更加高效的编写代码脚本。

当我谈工具的时候我在谈什么

好工具那么多,你知道如何学吗

比知道一个工具更重要的是想明白如何学习一个工具。**比如为了以 VS code 为例进行说明,我甚至在今天上午直接写了一个 VS code 插件。**是的,写了一个插件,不是用了一个插件。

如何使用语雀快速发表自己的博客

拥有个人博客的几种途径

在越来越多的人已经没有耐心读完 140 字微博(micro-blog),短视频逐渐占据人们更多注意力的今天,博客(blog)——这一上个时代的产物——似乎正在被我们渐渐遗忘。

biotools 综合性生物信息工具资源网站

生物信息涉及到的工具方法过于庞杂,很多时候接触到一个新的内容总是不知该去哪里找相关的工具,还有很多时候找到的工具太多又不知道该用哪个。之前写过两篇文章 66 种测序数据分析方法和流程如何快速找到自己需要的 R 包。分别从测序数据类型和 bioconductor 包两个角度介绍如何快速找到自己需要的工具。

听说你也有 emojifont 的字体使用困惑

问题复现

Y 叔有一个神包,能够在 ggplot 图层里随心所欲的添加各种 emoji,然而很多人在使用的时候却不能「随心所欲」,经常一行函数输进去一张白板输出来。最近在我的星球里也有人提到这个问题,作为一个无趣的人我虽然之前没有实际使用过这个有趣的包,但是今天要被迫营业了。