随时随地跟踪最新热点文献

随时随地跟踪最新热点文献

本文的图表及主要内容均来自 Meta-Research: Tracking the popularity and outcomes of all bioRxiv preprintsRxivist.org: Sorting biology preprints using social media and readership metrics 两篇文献,一篇发表在elife一篇发表在plos biology,如果有兴趣不妨直接阅读原文。

另外,说一句题外话,关于「bioRxiv」如何发音这个事可能每个人都有不一样的读法,在上面的文献中给出了正确的发音方式,「bioRxiv」的发音等同于「Bio Archive」。

一句话读完全文版

只要有网络随时随地用电脑或者手机打开 Rxivist 这个网站就都给你安排明白了。

bioRxiv 发展情况分析

如下图所示,截至 2018 年 11 月底,bioRxiv 上已经发表了 37,648 份预印本。值得一提的是,2018 年前 11 个月(18,825 份)的预印本比前四年的总预算数量还要多。其中,神经科学、生物信息学和进化生物学是排名前三的系列。

如果使用预印下载次数作为读者数量的指标,bioRxiv 在读者中也在迅速的流行起来就。如下图所示,2018 年 10 月的总下载量(1,140,​​296)比 2017 年同期增加了 82%,与 2016 年同期相比则增长了 115%。BioRxiv 预印本文章在 2018 年前 11 个月一共被下载了近 930 万次,仅仅在2018 年 10 月和 11 月,bioRxiv 的下载量(2,248,652)比网站前两年半还要多。每篇论文的下载量中位数为 279,其中基因组学类别每篇文献的下载中位数最高达到了 496。

除了统计下载数据外,bioRxiv 还会记录预印本在其它期刊中的发表情况。根据 bioRxiv 预印本与其它出版物的关联记录来看,总共发布了42.0%(15,797 篇)bioRxiv 预印本。按比例统计,进化生物学预印本具有最高的出版率。

总体而言,15,797 篇 bioRxiv 预印本已出现在了 1,531 种不同的期刊中。Scientific Reports 发表最多其次是 eLife 和 PLOS ONE。不过可能还需要考虑到每个期刊上发表的论文总数的不同。例如,Scientific Reports 在 2018 年发布了 398 份 bioRxiv 预印本,仅占其当年发表的 16,899 篇文章的 2.36%。相比之下,eLife 2018 年的 1,172 篇文章中有三分之一以上首次出现在 bioRxiv 上,而 GigaScience 在 2018 年发表的文章中预印本比例最高(49.4%),其次是 Genome Biology( 39.9%)和 Genome Research (36.7%)。

另外,每篇论文的下载数量与发表期刊影响因子之间存在显着的正相关:一般,影响因子较高的期刊会发布具有更多下载量的预印本。例如,Nature Methods(2017 IF 26.919)发表的 119 份 bioRxiv 预印本下载中位数为 2,266。相比之下,PLOS ONE(2017 IF 2.766)已发表的 719 个预印本下载中位数为 279。

通过检索所有已发表预印本的发表日期可以全面了解预印本首次发表在 bioRxiv 的日期与其他期刊发布日期的间隔。统计显示,其间隔中位数为 166 天(5.5 个月)。75% 的预印本是在 bioRxiv 发布的 247 天内发表的,90% 在 346 天内发表。

跟踪最新热点文献

在这些数据的基础上,开发者们又开发了一个 配套的网站 供大家使用,可以根据下载数量和在社交平台的热度随时掌握最新的热门预印本文献。

这个网站每天 6 次从 bioRxiv 中提取新的预印本信息并从推特上检索其热度,反映当前人们正在讨论哪些文献,这意味着在这里你每天总能找到新的内容。在默认索引视图中,当天包含超过 110 条推文的预印本标有「红红火候」的图标,提醒你需要重点关注。因为下载数量是按月统计的,所以这个指标一般是两周更新一次。同时,也可以按照具体的类别来进行筛选过滤。

另外,网站还有其它几个界面用不同的方式对数据进行分析,比如有一个页面列出了2018年最受欢迎的预印本论文,而在摘要页面中可以通过可视化的形式看到 bioRxiv 的各种整体指标。如果你点开某一篇具体的文献,还可以看到详细的统计信息,会显示该文献每个月的下载数量。

更贴心的是,每个预印本还提供了详细的作者信息列表,可以连接到每个作者的个人资料页,而且还会通过一些 ID来合并作者的所有预印本数据。在作者索引页面,你还可以筛选某个类别中哪些作者的文献被下载的次数更多。

顺便多说一句,如果你是一个比较硬核的用户网站还提供了比较详细的 API 供使用,如果你习惯邮件订阅,网站还提供了每周热点邮件推送服务。


本文作者:思考问题的熊

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